Решение о протоколе ЭКО принимается с учётом эффективности для конкретной пары, а не по простоте. Частые объективные причины рекомендации ЭКО: непроходимость маточных труб, выраженный мужской фактор, значительное снижение овариального резерва, возраст, многолетнее бесплодие или многократные неудачные попытки другими методами. Оценивают возраст, гормоны, количество фолликулов, предыдущие беременности и операции, качество спермы и реакцию организма. Двум парам с одинаковым диагнозом могут предложить разные тактики. Рекомендация ЭКО означает, что в текущей ситуации этот путь даёт наилучшие шансы на беременность.